LAMMPS模拟过程涉及较多的命令，一般来说主要分为以下几个流程

/////////////////

//初始参数

/////////////////

 

//模型初始化

units

boundary

atom_style

 

//设置键势类型

bond_style

//设置键角类型

angle_style

//设置二面角势类型

dihederal_style

//设置对势类型

pair_style

//读取结构数据

read_data

 

//设置邻近原子参数

neighbor

neigh_modify

 

/////////////////

//计算区域

/////////////////

//设置多久输出一次数据

//弛豫

nve

//温度设置

 

//设置系综

nve nvt npt

 

//热力学输出（显示在屏幕上）

thermo_style

thermo

 

//设置步长

timestep

 

//*将步数的计数器设置为指定值，设为0即清空

reset_timestep 0

 

//开始计算

run 1000（计算多少步，模拟时长为 步数*时间步长）